Molecular del VIH
IRYCIS-Hospital Ramón y Cajal
Molecular del VIH
IRYCIS-Hospital Ramón y Cajal
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio es un software de uso gratuito con una interfaz intuitiva y fácil de usar diseñado para explorar la variabilidad genética.
Su amplio conjunto de herramientas engloba el procesamiento de secuencias, el análisis de conservación y variabilidad, la generación de secuencias consensos y la identificación de mutaciones o cambios en aminoácidos, incluyendo herramientas especializadas para el análisis de VIH y SARS-CoV-2.
Requiere instalar Java
Virus
Herramientas específicas para el análisis de conservación y mutaciones de resistencia al VIH, y rastreo de proteínas del SARS-CoV-2.
Variabilidad
Identifica polimorfismos, determina la frecuencia de conservación o mutación, deriva consensos y calcula el coeficiente de Wu-Kabat.
Homología
Rastreador
Busca proteínas y secuencias diana dentro de un conjunto de secuencias más largas.
Alineamientos
Alinea, elimina inserciones y crea gráficos dot-plot.
Herramientas
Edita archivos.
Filtra, cuenta o traduce secuencias. Automatiza las funciones de EpiMolBio.
Virus
Herramientas específicas para el análisis de conservación y mutaciones de resistencia al VIH, y rastreo de proteínas del SARS-CoV-2.
Variabilidad
Identifica polimorfismos, determina la frecuencia de conservación o mutación, deriva consensos y calcula el coeficiente de Wu-Kabat.
Homología
Rastreador
Busca proteínas y secuencias diana dentro de un conjunto de secuencias más largas.
Alineamientos
Alinea, elimina inserciones y crea gráficos dot-plot.
Herramientas
Edita archivos.
Filtra, cuenta o traduce secuencias. Automatiza las funciones de EpiMolBio.
Cómo citar
Troyano-Hernáez P, Reinosa R, Holguín A. Genetic Diversity and Low Therapeutic Impact of Variant-Specific Markers in HIV-1 Pol Proteins. Front Microbiol. 2022 Jul 14;13:866705. doi: 10.3389/fmicb.2022.866705. PMID: 35910645; PMCID: PMC9330395 (cita provisional).
Creadores
Roberto Reinosa
Investigador de EpiMolVIH
Bioinformático
Dra. África Holguín
Investigadora del SNS
Jefa de EpiMolVIH
Paloma Troyano-Hernáez
Investigadora de EpiMolVIH
Médico Microbióloga
Roberto Reinosa
Investigador de EpiMolVIH
Bioinformático
Dr. África Holguín
Investigadora del SNS
Jefa de EpiMolVIH
Paloma Troyano-Hernáez Investigadora de EpiMolVIH Médico Microbióloga
Agradecimientos
IRYCIS – Unidad de Innovación
Diego Velasco Escribano
Emma González Seiz
Beatriz Alonso de Diego
IRYCIS – Unidad de Bioinformática
Val Fernández Lanza
Ana Valadés Alcaraz
IRYCIS – Unidad de Innovación
Diego Velasco Escribano
Emma González Seiz
Beatriz Alonso de Diego
IRYCIS – Unidad de Bioinformática
Val Fernández Lanza
EpiMolVIH
Ana Valadés Alcaraz