Molecular del VIH
IRYCIS-Hospital Ramón y Cajal
Molecular del VIH
IRYCIS-Hospital Ramón y Cajal
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio™
Análisis de variabilidad genética
EpiMolBio es un software de uso gratuito con una interfaz intuitiva y fácil de usar diseñado para explorar la variabilidad genética.
Su amplio conjunto de herramientas engloba el procesamiento de secuencias, el análisis de conservación y variabilidad, la generación de secuencias consensos y la identificación de mutaciones o cambios en aminoácidos, incluyendo herramientas especializadas para el análisis de VIH y SARS-CoV-2.
Requiere instalar Java
Virus
Herramientas específicas para el análisis de conservación y mutaciones de resistencia al VIH, y rastreo de proteínas del SARS-CoV-2.
Variabilidad
Identifica polimorfismos, determina la frecuencia de conservación o mutación, deriva consensos y calcula el coeficiente de Wu-Kabat.
Homología
Rastreador
Busca proteínas y secuencias diana dentro de un conjunto de secuencias más largas.
Alineamientos
Alinea, elimina inserciones y crea gráficos dot-plot.
Herramientas
Edita archivos.
Filtra, cuenta o traduce secuencias. Automatiza las funciones de EpiMolBio.
Virus
Herramientas específicas para el análisis de conservación y mutaciones de resistencia al VIH, y rastreo de proteínas del SARS-CoV-2.
Variabilidad
Identifica polimorfismos, determina la frecuencia de conservación o mutación, deriva consensos y calcula el coeficiente de Wu-Kabat.
Homología
Rastreador
Busca proteínas y secuencias diana dentro de un conjunto de secuencias más largas.
Alineamientos
Alinea, elimina inserciones y crea gráficos dot-plot.
Herramientas
Edita archivos.
Filtra, cuenta o traduce secuencias. Automatiza las funciones de EpiMolBio.
Cómo citar
Reinosa R, Troyano-Hernáez P, Valadés-Alcaraz A, Holguín Á. EpiMolBio: A novel user-friendly bioinformatic program for genetic variability analysis. Comput Struct Biotechnol J. 2025 Jun 26;27:2968-2975. doi: 10.1016/j.csbj.2025.06.034. PMID: 40687996; PMCID: PMC12273208..
Creadores
Roberto Reinosa
Investigador de EpiMolVIH
Bioinformático
Dra. África Holguín
Investigadora del SNS
Jefa de EpiMolVIH
Paloma Troyano-Hernáez
Investigadora de EpiMolVIH
Médico Microbióloga
Roberto Reinosa
Investigador de EpiMolVIH
Bioinformático
Dr. África Holguín
Investigadora del SNS
Jefa de EpiMolVIH
Paloma Troyano-Hernáez Investigadora de EpiMolVIH Médico Microbióloga
Agradecimientos
IRYCIS – Unidad de Innovación
Diego Velasco Escribano
Emma González Seiz
Beatriz Alonso de Diego
IRYCIS – Unidad de Bioinformática
Val Fernández Lanza
Ana Valadés Alcaraz
IRYCIS – Unidad de Innovación
Diego Velasco Escribano
Emma González Seiz
Beatriz Alonso de Diego
IRYCIS – Unidad de Bioinformática
Val Fernández Lanza
EpiMolVIH
Ana Valadés Alcaraz